Le président Bouteflika a fortement critiqué l’attitude du président malien Mamadou Toumani Touri par rapport à lutte contre les terroristes qui agissent dans le Sahel saharien. « Le président malien ne peut pas être ami des voleurs et des victimes en même temps », a déclaré le président algérien lors d’une audience, en novembre 2009, accordée  au général américain William Ward, patron du commandement militaire pour l’Afrique (Africom). Bouteflika a demandé au responsable américain que son gouvernement le fasse savoir clairement au chef d’Etat malien. Bouteflika a relevé qu’au moment où l’Algérie demandait à mener des interrogatoires avec des suspects, le Mali menait des négociations avec des organisations terroristes pour libérer ces mêmes suspects. « Il est difficile de coopérer dans de telles conditions », a-t-il dit.
 
Le président algérien s’est félicité du soutien accordé par les Etats-Unis au Mali et il a rappelé que l’Algérie a également apporté son assistance à son voisin du Sud. Il a plaidé en faveur d’une coopération entre les pays du Sahel pour contrer la menace terroriste ». Bouteflika n’utilise à aucun moment l’appellation Al Qaida.